Hola:
Si quieres hacer la excursión en grupo fenomenal, sino hacerla por libre es muy fácil y mucho más barato.
Al salir del barco, hay unos buses free que os dejan en la entrada del muelle de Civitavecchia (5'), desde ahí gira a la derecha, por una avenida grande, el mar a tu mano derecha, camina 10' y llegas a la estación de tren. Compras un billete BIRG, cuesta 9€ y vale ida-vuelta más metro y buses todo el día.
Pasados 50' llegarás a San Pietro, bajas aqui y ya estarás en el Vaticano. La ruta a hacer sería Vaticano-Castel Sant Angelo-Plaza Navona-Panteón-Fontana di Trevi- Plaza de España.
En Plaza coges el metro dirección termini (3 paradas), bajas y buscas el metro dirección Coliseo (2 paradas), el trayecto se hace en 10'. Bajas en Coliseo, cruzas el foro palatino y acabas en Piazza Venecia.
De espaldas a la plaza, la primera calle a la derecha tiene una parada de bus. Coges el nº 64 que te dejará en Termini. Desde Termini, si vas bien de tiempo puedes ver las termas de Diocleciano o Santa Maria Maggiore. Cuando acabes a Termini, andenes del 26 al 29 para coger el tren de regreso a Civitavecchia. Calcula el trayecto de vuelta de 1 hora más o menos.
Si el barco es de Royal partirá a las 19horas, te recomiendo no salir más tarde de las 17 horas. De vuelta a Civitavecchia dirección entrada del muelle donde estarán los buses que te devolverán al barco.
Te dejo un link con el mapa de Roma. Localiza los puntos que te he puesto y verás que el recorrido es bastante completo habida cuenta que el tiempo es muy corto para ver una ciudad como Roma. Pincha en el mapa 2 veces y se te abrirá ampliado, imprime las ampliaciones y junta todo el mapa para que lleves la ruta localizada.
Un saludo
www.romereservation.com/rome-map.php